像素射击故事模式第三关的核心通关流程是寻找三个金色方块物质并穿越沙漠光柱。进入关卡后首先需要在地图各处搜寻三个特定金色方块，这些方块通常分布在显眼位置但需要玩家仔细探索每个角落。完成收集后系统会提示穿越沙漠，需要抬头寻找天空中的光柱并朝其方向持续前进。
穿过光柱后会进入后续区域，需要走过两座桥到达第三个岛屿。这段路程中可能会遇到少量敌人但无需恋战，保持移动效率是关键。在第三座岛上要找到特定图案标识的飞行员NPC，这是通关的重要节点。与飞行员互动后继续向前探索就能发现最终的通关目标飞机，靠近飞机即可完成本关。整个过程中沙漠区域的光柱指引和飞行员的定位是需要特别注意的关键点。
对于操作技巧方面，建议保持平稳移动避免无谓跳跃消耗时间。使用基础冲锋枪这类易操控武器可以应对途中遇到的敌人，不必追求高伤害武器。注意保留弹药应对可能出现的突发战斗情况，但总体而言第三关的战斗压力相对较小。视角调整要灵活，特别是在寻找高空光柱时需要适当抬高视角观察环境。
地图探索时推荐按顺时针或逆时针方向系统性地扫描每个区域，避免重复往返浪费时间。三个金色方块的收集顺序不影响通关，但建议先完成边缘区域再处理中心区域。沙漠穿越阶段如果暂时找不到光柱，可以尝试重置视角或小范围绕圈直到发现目标。最后岛屿区域的建筑结构较为复杂，注意观察地面箭头标记或特殊纹理指引方向。
通关后可以回顾本关的探索路径优化下次游玩效率。重点记忆金色方块的刷新点位和光柱出现规律，这些元素在重复挑战时位置基本固定。虽然关卡设计允许一定容错空间，但精确执行每个阶段目标仍是快速通关的基础。后续挑战更高难度时，这些基础路线和关键点识别技巧仍然适用。
